Симптоматика заболевания одинаковая как у взрослых, так и у детей. Первым признаком является визуальная разница в диаметрах зрачков глаз. Если разница в диаметре незначительная, но пациент не испытывает кроме косметического дефекта никакого дискомфорта. При большой разнице в диаметрах зрачков может возникнуть:
затуманенность;
головная боль;
быстрое переутомление глаз.
При сопутствующих глазных инфекциях пациент может жаловаться на повышенное слезоотделение, жжение, боль, может возникнуть отечность и покраснение глаз. Если причиной заболевания является травма головного мозга, то симптомами служат: головная боль, тошнота, головокружение, нарушение рефлексов, боязнь света, высокая температура. В случае неврологических заболеваний, которые поспособствовали появлению анизокории, может опуститься веко, глазное яблоко может немного выпячивать, нарушается чувствительность, также на стороне поражения может быть снижено потоотделение.


